孙殿英的兵匪们很明确的目的是盗取珍宝，慈禧的尸体对他们来说毫无用处，所以他们在打开棺材见到慈禧的尸体之后，就把她拉了出来，并且随手扔到了地宫的西北角处。
慈禧陵中的珍宝数不胜数，当时打开棺材之后，孙殿英下令只有营长以上的军官才可以到棺材之中拿取宝贝。《顺天时报》曾报道说，“为营长以上始能入内拿取东西”，说的就是这个意思。
后来孙殿英调集来20辆大车，运走了大量的珍宝。那些珍宝在当时全都是价值连城之物。阎锡山曾说，单是孙殿英部下谭温江在北平出售的珍宝就价值10万元，其他的具体还有多少，就不得而知了。
晚清太监李莲英有个义子李成武，这个李成武的儿子李营舟说过，慈禧葬物，若均追回，足以富国。也就是说，慈禧几乎把宫中所有值钱的宝贝都带进了她的地宫。种种记载也都说明，慈禧陵中这些珍宝真的很多，但是始终没有一个确定的价格被估计出来。
那么，孙殿英在盗墓的时候究竟盗走了哪些名贵的珍宝呢？首先就是上文提到的慈禧口中所含的夜明珠，这颗夜明珠光芒耀眼，可想而知是十分珍贵的，所以孙殿英当时就将其盗走了。后来，这个夜明珠落在了蒋介石的夫人宋美龄的手中，宋美龄当时把它缀在了两只拖鞋上。
而最终这颗珠子还是流落到了民间，至今下落不明。
另外一个珍宝就是翡翠西瓜，它重达三十六两八钱，其个头是非常之大的。从这个翡翠西瓜的外观纹理上看，它是一个花皮瓜。然后通过它的截面，可以看到暴露出来的西瓜子，西瓜子为黑色，西瓜瓤则是粉红色的，这个西瓜的形象相当逼真，与真正的西瓜相差无几。据说当时老佛爷就枕在这个西瓜之上。
第三个宝贝就是翡翠蝈蝈白菜，它比翡翠西瓜稍微小一些。这个翡翠白菜，从菜心、菜叶、菜帮到菜根，都是天然的颜色，所以这个翠料的珍贵程度是显而易见的。比如，菜心有一些发白，菜叶则很绿，菜帮又有些白，菜根是天然的泥色，这些都是天然呈现出来的颜色。最为重要的是在菜叶子上落着一只碧绿的蝈蝈，在菜心上还有几只黄色的马蜂。更神奇的是，传说在下雨的时候，上面的马蜂会滑落到菜心下面去避雨。
后来，孙殿英盗挖慈禧墓后，这颗翡翠白菜不知所踪，至今仍没有找到它的下落。而我们后世在民间所看到的一些照片，其实是台北“故宫博物院”当中的翡翠白菜，那是瑾妃出嫁时娘家陪嫁的礼品。
然后就是十分著名的慈禧的盖尸被，名为陀罗尼经被。在清朝，陀罗尼经被是皇帝钦赐的，没有得到赏赐的人是不得使用的。而且要按等级来使用，其质地、颜色都有很大的区别。一般的帝后的陀罗尼经被，都是在上面书写上藏文的陀罗尼经咒，也有织绣上去的。
但是慈禧的这床被，却是非同寻常，她不仅使用了织锦，而且上面的文字不是藏文，而是汉字，所以这个织绣的过程相对来讲就很复杂，要注意汉字的经线和纬线，那是很困难的。
而除了文字，这个经被上面还有很多的图案，有佛像、龙、罗汉像和佛塔等，图像众多，表达出慈禧“慈航普度”这样一个概念。
同时，经被上的每一个文字之上，都缝缀了一颗大珍珠，整个被子上珠子的总数量达到了820粒，这无疑使这床被的价值瞬间又提高了。
慈禧的这条被子大约3米见方，把她的尸体和珍宝全都牢牢盖住。然而孙殿英兵匪在盗墓的时候，却并没有重视它。因为这些兵匪基本上都是一些粗鲁莽夫，完全不识货，只看到被子上有闪闪发亮的820粒珍珠，就把珠子拆掉拿走了。
还有慈禧生前精心准备的寿衣，里外一共三件。最外面一层是佛字龙袍，是一件前无古人的寿衣一因为从来没有见过有哪一个皇帝或者皇后的朝服或者寿衣上绣有“佛”字，所以慈禧的这个设计是独一无二的。而且每个字上面也是同样缀有珍珠，整件衣服珠光宝气的。她第二件寿衣是一件绣有团寿字的袍子，最里面的是一套福寿合体之衣，皆为每个字上面都缀以珍珠。
可见慈禧这三件寿衣的价值是不可估量的，但是孙殿英的兵匪同样没有重视它，和对待陀罗尼经被一样，他们从慈禧身上把衣服扒下来之后，只把珠子给拆走了。
除了这些珍珠，慈禧的棺材之中还有海量的东珠。我们知道这种东珠在清朝非常受重视，民间根本不允许使用——只有皇家才能采摘和使用。
在慈禧下葬时，珍珠是一升一升地倒入棺中的，用以填补棺缝，这些珍珠把慈禧的尸身周围填补得严严实实。
而关于这些珍珠的拿取，孙殿英是有规定的，就是把大珍珠拿走，所以当时那些兵匪还有幸分得了一些小珍珠，也就是米珠。
最后，在慈禧棺材外面，还有一些宝贝，就是香册和香宝。顾名思义，这些香册、香宝是用檀香木制成的。香册一共10页，在上面雕刻着慈禧这一生的功绩，同时也对其一生进行评论，可谓盖棺定论之语。当然，这也是对香宝之上的文字的注释和说明。香宝则是慈禧的谥号大印，为方字的交龙钮，雕刻着慈禧22个字的谥号。所以这两样东西上的文字是很重要的，是对慈禧一生的评价。
不过那些兵匪当时并没有认识到它们的珍贵，一看既不是金银玉器，也不是珍珠，就把它们给扔掉了，所以它们没有流落民间，我们后世也才得以一睹这两件宝物的真容。
除了以上这些，慈禧陵中还有许多其他的珍宝，难计其数，至今也无确切数字，难怪当时奉命审理此案的河北省政府主席商震发出这样的感慨：“陪葬物品究有几种，究系何物，陵员等不知其详。”也就是说不仅守陵人弄不清楚，连商震这个审理主官也是一头雾水。所以说慈禧陵中具体的珍宝数量，至今还是一个未解的谜案。