endogenous small interfering RNAs(endo-siRNAs) 内源性小干扰RNA

小干扰RNA又叫短干扰RNA或者沉默RNA,是一类由20~25个碱基组成的双链RNA分子。其作用非常广泛,主要是与特定基因的互补序列结合而干扰其表达。小干扰RNA还在RNA沉默通路中发挥作用,例如抗病毒机制及基因组染色质结构的塑造等。内源性小干扰RNA起源于长双链RNA前体(包括顺式、反式及发夹RNA前体)。起初认为其主要作用是对抗外源性双链RNA,但现在发现也可调控内源mRNA的表达。另外有一类特殊的小干扰RNA叫做重复序列相关siRNA,主要来源于一些具有重复序列的逆转录转座子如Alu及LINE等。目前只在线虫中发现了完整的内源性小干扰通路。在线虫中,初级小干扰RNA由双链RNA加工而成,但其在线虫体内却非常少见,相反,由初级小干扰RNA剪切过的靶基因的3′端被RNA依赖的RNA多聚酶识别并加工而形成的次级小干扰RNA却很常见。最近在果蝇及小鼠的研究中发现內源性小干扰RNA可以有多种来源,如转位因子、互补退火转录本、发夹RNA、顺式天然反义转录本、哺乳动物假基因等,但其特异的生物学功能尚未明确。小干扰RNA是通过核酸内切酶DCL2、DCL3和DCL4对具有较好互补结构的长双链RNA前体进行加工形成的,而这些长双链RNA前体来源于反义转录本,或者由RNA依赖的RNA多聚酶加工而成。小干扰RNA在植物体内主要有四种:反式激活的siRNA、天然反义转录本来源的siRNA、异染色质siRNA或者叫做重复序列相关siRNA,还有长siRNA。参见short interfering RNA/small interfering RNA